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125家单位联合完成微生物组实验手册(Microbiome Protocol eBook)第1版

宏基因组 宏基因组 2022-05-08

微生物组实验手册(Microbiome Protocol eBook)

正式发布


在过去20年里,微生物组学在人类、动物、植物和环境领域均取得了突破进展。迄今为止,每年有数万篇相关研究论文发表,扩展了我们对医学、生物学、地球科学、环境科学以及农业科学的认识。人类微生物组计划(HMP)、地球微生物计划(EMP)、中国科学院微生物组计划等联合项目成立,促进了微生物组学的迅猛发展。然而,在通用和个性化的实验和分析等方面仍缺少系统的实验方法,限制着广大同行深入开展本领域研究,同时存在着不同研究团队方法不统一、实验难重复、和同行研究不可比较等诸多问题。

为解决以上问题,Bio-protocol中国编辑部宏基因组公众号联合华人科学家们共同发起微生物组实验手册(Microbiome Protocols eBook, MPB)项目。旨在促进微生物组领域国内外华人科研团队之间的交流和合作,倡导科研团队注重实验方法的沉淀、分享与传播。希望本电子书能够填补微生物组领域方法空白,解决实验和分析难重复的问题,推动实验标准化,为积累标准统一的数据和未来大数据整合分析做准备,助力微生物组学研究的发展。

微生物组实验手册封面

内 容 主 题


微生物组实验手册的主题为微生物组,包括培养组、扩增子、宏基因组、宏转录组、代谢组、单菌基因组、相关分子生物学和微生物学实验,以及微生物组学上下游相关实验和分析技术等。按研究对象分类主要包括人、动物、植物、环境、通用、土壤、水体、细菌、真菌、病毒等。按研究方法分类主要包括样本制备、核酸提取、蛋白提取、代谢物提取、测序文库制备、微生物分析培养与鉴定、合成菌群、无菌实验、数据分析、微生物学常用实验和分析等。这些实验方法的发表,将极大地推动微生物组领域的发展,以及向其他领域的扩展和应用。

微生物组实验手册:架起各领域通向微生物组世界的桥梁



专 家 团 队



微生物组实验手册项目集合了来自125个研究所或大学的352名作者和167位评审参与该项目,其中包括中国科学院遗传与发育生物学研究所、南京土壤研究所、微生物研究所、生态环境研究中心、城市环境研究所、中国农业科学院等研究所,北京大学、清华大学、浙江大学、中山大学、山东大学、扬州大学、西湖大学、南京农业大学等大学。

微生物组实验手册第一版共有146篇实验方法通过同行评审,并于2021年11月正式发布。本项目所有文章开放获取,任何人可通过Bio-protocol官网(https://bio-protocol.org/bio101/mpb)、微信公众号、Google Scholar、知网、CSDN等多种途径免费访问。

科学顾问

特邀主编

特邀编委

持 续 更 新


为了提高本实验手册的质量以及方法的多样化,微生物组实验手册将作为长期项目不断更新、汇总和发表最新的实验方法。我们诚邀更多国内外优秀同行参与本项目,一起打造可为本领域提供可参考的方法的百科全书。欢迎广大优秀同行扫描下方二维码,关注并加入微生物组学讨论群,提出您的建议,发表您的看法,为推动微生物组学的发展贡献力量。
   

或者添加小Bio微信,拉你入群:18310791524



Bio-protocol简介



Bio-protocol于2011年在斯坦福大学创建,致力于搭建全球权威的、高质量的生物实验方案分享平台,以助力科学发现。Bio-protocol期刊是Bio-protocol旗下一份同行评审的国际学术期刊,发表高质量的生命科学实验方案,旨在提高科研的可重复性。至今,平台已发表了来自全球上万名优秀科研工作者(包括多名诺贝尔奖获得者)的4000多篇实验方案,并且同Science等多家国际权威科学杂志建立长期合作关系,共同促进科研的可重复性。目前,Bio-protocol期刊已被PubMed Central,Web of Science (ESCI) 、Scopus收录。

Bio-101是Bio-protocol旗下一个生命科学实验方法的社区平台。其使命是为生命科学研究工作者搭建一个共享和讨论实验方法的开放平台,提高实验的可重复性、让科研更高效。


宏基因组简介



宏基因组公众号成立于2017年7月,致力于本领域方法和成果的交流与传播,推动全球华人微生物组发展。编辑团队由10余名在NatureScienceCell子刊等有发表经验的一线青年科研人员组成,保证每天专业、高质量文章的分享。

目前已分享2800+篇原创文章,125000+同行关注,累计阅读2800万+。参与QIIME 2开发,受邀在Protein CellCurrint OpinionChinese Medical Joural等杂志撰写方法综述。

诚邀同行投稿分享,共同打造本领域纯干货技术和思想交流平台。
点击阅读原文访问《微生物组学实验手册》

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